土豆發芽與儲存環境濕度、光照、溫度及通風條件密切相關，控制關鍵因素可有效抑制發芽。
1、避光存放：
光照會激活土豆表皮龍葵堿合成，導致芽眼萌發。建議使用黑色塑料袋或紙箱密封，置於櫥櫃等暗處。實驗表明避光儲存的土豆發芽時間可延遲3倍以上。
2、低溫控制：
4-8℃環境能顯著抑制馬鈴薯淀粉酶活性，傢庭可將土豆放入保鮮袋後冷藏於冰箱蔬果室。註意避免與蘋果等乙烯釋放量大的水果混放，防止催熟作用。
3、濕度調節：
65%-75%相對濕度最理想，過於幹燥會導致皺縮，過濕易黴變。可在儲存容器放置食品幹燥劑或半幹毛巾，定期更換調節濕度。地窖儲存時可鋪墊木屑吸潮。
4、隔絕氧氣：
真空密封能使土豆處於休眠狀態，傢用抽真空機處理後可延長保鮮期2個月。短期儲存可用鹽水浸泡法，5%濃度鹽水浸泡10分鐘晾幹，形成保護膜阻隔氧氣。
5、分裝管理：
破損土豆會釋放乙烯加速周邊塊莖發芽，需每周檢查並剔除發芽、黴變個體。建議按每次用量分裝，減少開封次數。新老土豆分開存放，老土豆更易發芽。
儲存期間可搭配飲食消耗方案，土豆富含維生素C和鉀元素，適合制作土豆泥、燉牛肉等菜肴。運動後補充土豆能快速恢復肌糖原，建議選擇蒸煮方式保留營養。發現輕微發芽可深挖芽眼後食用，但發芽面積超過1/3或變綠則需丟棄，避免龍葵堿中毒風險。長期儲存建議選擇表皮厚實的晚熟品種，收獲後經過2周愈傷處理的土豆耐儲性更佳。