激光脫毛手術可能存在皮膚灼傷、色素沉著、毛囊炎、暫時性紅斑及毛發再生等缺點。激光脫毛通過選擇性光熱作用破壞毛囊，但操作不當或個體差異可能導致不良反應。
激光脫毛過程中若能量參數設置過高或操作者技術不熟練，可能造成皮膚表層灼傷，表現為局部紅腫、水皰或結痂。術後護理不當或紫外線暴露可能引發色素沉著，膚色較深者風險更高。毛囊炎因毛囊受損後細菌感染所致，常見於術後清潔不足或體質敏感者。部分人治療後出現暫時性紅斑，通常1-3天自行消退。激光僅對生長期毛發有效，休眠期毛囊可能再生毛發，需多次治療才能達到理想效果。
術後需避免陽光直射並使用醫用修復產品，減少色素沉著風險。治療區域保持清潔幹燥，防止感染。選擇正規醫療機構及合適波長設備可降低不良反應概率。若出現持續疼痛、化膿等異常癥狀應及時就醫。